Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P4

Ighv5-16, Immunoglobulin heavy variable 5-16 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ighv5-16A0A0B4J1P4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ighv5-16A0A0B4J1P4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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