Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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