Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm24580-201ENSMUST00000103965 131 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Hoxd9P28357 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Hoxd9P28357 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Hoxd9P28357 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Hoxd9P28357 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Hoxd9P28357 Gm29344-201ENSMUST00000068143 210 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Hoxd9P28357 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd9P28357 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd9P28357 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd9P28357 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd9P28357 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd9P28357 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Hoxd9P28357 Gm22717-201ENSMUST00000122703 171 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd9P28357 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd9P28357 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd9P28357 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Hoxd9P28357 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Hoxd9P28357 Gm37778-201ENSMUST00000191732 190 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Hoxd9P28357 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Hoxd9P28357 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Hoxd9P28357 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Hoxd9P28357 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Hoxd9P28357 Gm22087-201ENSMUST00000158339 88 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Hoxd9P28357 Gm27937-201ENSMUST00000183605 88 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Hoxd9P28357 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Hoxd9P28357 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Hoxd9P28357 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Hoxd9P28357 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Hoxd9P28357 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.14
Hoxd9P28357 Mir669h-201ENSMUST00000116944 125 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Gm22474-201ENSMUST00000179407 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Mir376b-201ENSMUST00000195930 82 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Mir7673-201ENSMUST00000184567 64 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Gm25440-201ENSMUST00000158279 154 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Gm24996-201ENSMUST00000158390 99 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Gm25040-201ENSMUST00000103877 66 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Mir6394-201ENSMUST00000184738 99 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Snord95-201ENSMUST00000082846 68 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 n-R5s12-201ENSMUST00000083785 119 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Gm26375-201ENSMUST00000101829 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Gm22761-201ENSMUST00000102278 96 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Gm22785-201ENSMUST00000104087 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Gm11084-201ENSMUST00000112062 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Gm22459-201ENSMUST00000082577 108 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hoxd9P28357 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
Hoxd9P28357 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Hoxd9P28357 Gm22469-201ENSMUST00000104118 133 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hoxd9P28357 Gm23012-201ENSMUST00000104149 83 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hoxd9P28357 Gm22965-201ENSMUST00000157958 101 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hoxd9P28357 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hoxd9P28357 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hoxd9P28357 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hoxd9P28357 Olfr867-203ENSMUST00000216538 4617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Hoxd9P28357 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hoxd9P28357 Gm23590-201ENSMUST00000157661 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hoxd9P28357 Gm25010-201ENSMUST00000158403 65 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hoxd9P28357 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hoxd9P28357 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hoxd9P28357 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hoxd9P28357 Gm42677-201ENSMUST00000196363 127 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hoxd9P28357 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hoxd9P28357 Gm45741-201ENSMUST00000212661 152 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
Hoxd9P28357 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hoxd9P28357 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
Hoxd9P28357 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hoxd9P28357 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hoxd9P28357 Gm24259-201ENSMUST00000083740 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hoxd9P28357 Mir669a-3-201ENSMUST00000102074 109 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Hoxd9P28357 Gm13065-201ENSMUST00000119178 141 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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