Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm22761-201ENSMUST00000102278 96 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Chmp3Q9CQ10 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Chmp3Q9CQ10 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Chmp3Q9CQ10 Gm23900-201ENSMUST00000157569 108 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Chmp3Q9CQ10 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Chmp3Q9CQ10 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Chmp3Q9CQ10 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Chmp3Q9CQ10 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
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Chmp3Q9CQ10 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Chmp3Q9CQ10 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Chmp3Q9CQ10 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Chmp3Q9CQ10 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Chmp3Q9CQ10 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Chmp3Q9CQ10 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Chmp3Q9CQ10 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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Chmp3Q9CQ10 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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Chmp3Q9CQ10 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Chmp3Q9CQ10 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Chmp3Q9CQ10 Gm24183-201ENSMUST00000122572 93 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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Chmp3Q9CQ10 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Chmp3Q9CQ10 Gm24638-201ENSMUST00000179807 132 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Chmp3Q9CQ10 Gm24203-201ENSMUST00000082949 114 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Chmp3Q9CQ10 Gm22544-201ENSMUST00000104349 127 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Chmp3Q9CQ10 Gm23528-201ENSMUST00000104571 132 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Chmp3Q9CQ10 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Chmp3Q9CQ10 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Chmp3Q9CQ10 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
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Chmp3Q9CQ10 Gm24384-201ENSMUST00000122693 75 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Chmp3Q9CQ10 Gm24686-201ENSMUST00000157755 93 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Chmp3Q9CQ10 Gm27975-201ENSMUST00000184400 101 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Chmp3Q9CQ10 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Chmp3Q9CQ10 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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Chmp3Q9CQ10 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Chmp3Q9CQ10 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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Chmp3Q9CQ10 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Chmp3Q9CQ10 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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Chmp3Q9CQ10 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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Chmp3Q9CQ10 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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Chmp3Q9CQ10 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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Chmp3Q9CQ10 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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Chmp3Q9CQ10 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Chmp3Q9CQ10 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Chmp3Q9CQ10 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Chmp3Q9CQ10 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Chmp3Q9CQ10 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Chmp3Q9CQ10 Mir29a-201ENSMUST00000083676 88 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Chmp3Q9CQ10 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Chmp3Q9CQ10 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Chmp3Q9CQ10 Mir1950-201ENSMUST00000158526 74 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Chmp3Q9CQ10 Gm26712-201ENSMUST00000180813 217 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Chmp3Q9CQ10 Gm38295-201ENSMUST00000191951 151 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Chmp3Q9CQ10 AC157602.1-201ENSMUST00000197446 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Chmp3Q9CQ10 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Chmp3Q9CQ10 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Chmp3Q9CQ10 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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