| Prm3 | Q62100 | Mir5112-201 | ENSMUST00000174897 | 60 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm25470-201 | ENSMUST00000175576 | 111 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm28591-201 | ENSMUST00000185259 | 183 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| Prm3 | Q62100 | AC154358.1-201 | ENSMUST00000224871 | 218 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| Prm3 | Q62100 | Zfp981-203 | ENSMUST00000179175 | 2953 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| Prm3 | Q62100 | Olfr1309-205 | ENSMUST00000216948 | 5168 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.98 | | |
| Prm3 | Q62100 | U6.1-201 | ENSMUST00000157443 | 101 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm22083-201 | ENSMUST00000157586 | 102 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm27511-201 | ENSMUST00000183502 | 127 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
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| Prm3 | Q62100 | Uty-201 | ENSMUST00000069309 | 5208 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
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| Prm3 | Q62100 | Gm43885-201 | ENSMUST00000204928 | 2542 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
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| Prm3 | Q62100 | Gm38323-201 | ENSMUST00000192450 | 210 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm43960-201 | ENSMUST00000204249 | 5020 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -2 | | |
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| Prm3 | Q62100 | Gm25300-201 | ENSMUST00000175284 | 84 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| Prm3 | Q62100 | Mir3470b-201 | ENSMUST00000175563 | 126 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm43722-201 | ENSMUST00000196054 | 124 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
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| Prm3 | Q62100 | Gm5581-201 | ENSMUST00000072940 | 2550 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm23667-201 | ENSMUST00000157466 | 120 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm26297-201 | ENSMUST00000179464 | 132 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| Prm3 | Q62100 | Mir6408-201 | ENSMUST00000183643 | 91 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm24745-201 | ENSMUST00000157840 | 85 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm27265-201 | ENSMUST00000183559 | 77 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm27786-201 | ENSMUST00000184337 | 70 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
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| Prm3 | Q62100 | Mir184-201 | ENSMUST00000083662 | 69 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm13065-201 | ENSMUST00000119178 | 141 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm37579-201 | ENSMUST00000194291 | 142 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm36551-201 | ENSMUST00000196787 | 300 nt | TSL 5 BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| Prm3 | Q62100 | AC167721.1-201 | ENSMUST00000217088 | 279 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| Prm3 | Q62100 | Mir101b-201 | ENSMUST00000083622 | 97 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm382-201 | ENSMUST00000096332 | 4070 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm23325-201 | ENSMUST00000157422 | 129 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| Prm3 | Q62100 | Scarna3a-201 | ENSMUST00000158911 | 140 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| Prm3 | Q62100 | C920009B18Rik-204 | ENSMUST00000181733 | 123 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| Prm3 | Q62100 | AC157278.1-201 | ENSMUST00000221621 | 148 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| Prm3 | Q62100 | Olfr1218-202 | ENSMUST00000213609 | 3760 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm24271-201 | ENSMUST00000102327 | 111 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm23012-201 | ENSMUST00000104149 | 83 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm12276-201 | ENSMUST00000121709 | 301 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm24138-201 | ENSMUST00000157572 | 114 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm26411-201 | ENSMUST00000157668 | 107 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm24808-201 | ENSMUST00000157993 | 118 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm24553-201 | ENSMUST00000158653 | 131 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm27554-201 | ENSMUST00000185074 | 98 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm25592-201 | ENSMUST00000082635 | 131 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm22956-201 | ENSMUST00000122520 | 80 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm24082-201 | ENSMUST00000175175 | 83 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm16399-201 | ENSMUST00000181423 | 219 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm27717-201 | ENSMUST00000183933 | 151 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| Prm3 | Q62100 | Mir7232-201 | ENSMUST00000197929 | 74 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm26458-201 | ENSMUST00000082832 | 128 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm23297-201 | ENSMUST00000083184 | 127 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| Prm3 | Q62100 | AF357428-201 | ENSMUST00000083815 | 69 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| Prm3 | Q62100 | Skint5-202 | ENSMUST00000169631 | 4497 nt | APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| Prm3 | Q62100 | Mir499-201 | ENSMUST00000102357 | 79 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| Prm3 | Q62100 | Mir3079-201 | ENSMUST00000175428 | 90 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm27700-201 | ENSMUST00000185003 | 81 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| Prm3 | Q62100 | Mir7217-201 | ENSMUST00000200304 | 62 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| Prm3 | Q62100 | Vmn1r75-204 | ENSMUST00000227611 | 4336 nt | APPRIS ALT2 BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm24118-201 | ENSMUST00000103972 | 126 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| Prm3 | Q62100 | Mir669h-201 | ENSMUST00000116944 | 125 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm22233-201 | ENSMUST00000157464 | 114 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm25868-201 | ENSMUST00000158253 | 114 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm23409-201 | ENSMUST00000158516 | 237 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm25402-201 | ENSMUST00000082966 | 131 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm24500-201 | ENSMUST00000158447 | 124 nt | BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| Prm3 | Q62100 | Snord95-201 | ENSMUST00000082846 | 68 nt | BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| Prm3 | Q62100 | n-R5s166-201 | ENSMUST00000082898 | 121 nt | BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm23708-201 | ENSMUST00000104367 | 123 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm13274-202 | ENSMUST00000137624 | 271 nt | TSL 3 BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| Prm3 | Q62100 | Mir5123-201 | ENSMUST00000177794 | 83 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm36776-201 | ENSMUST00000207006 | 203 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| Prm3 | Q62100 | Gm27450-201 | ENSMUST00000104632 | 90 nt | BASIC | 2.46 | □□□□□ -2.02 | | |