Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC4,06□□□□□ -1,76
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24134-201ENSMUST00000083361 71 ntBASIC4,05□□□□□ -1,76
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC4,04□□□□□ -1,76
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC4,04□□□□□ -1,76
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm25648-201ENSMUST00000177844 79 ntBASIC4,04□□□□□ -1,76
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC4,04□□□□□ -1,76
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC4,03□□□□□ -1,76
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC4,03□□□□□ -1,76
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4,03□□□□□ -1,76
Ppargc1bQ8VHJ7 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC4,02□□□□□ -1,77
Ppargc1bQ8VHJ7 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC4,02□□□□□ -1,77
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm23072-201ENSMUST00000158243 123 ntBASIC4,02□□□□□ -1,77
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC4,02□□□□□ -1,77
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28862-201ENSMUST00000188246 163 ntBASIC4,02□□□□□ -1,77
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43885-201ENSMUST00000204928 2542 ntBASIC4,01□□□□□ -1,77
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC4□□□□□ -1,77
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27297-201ENSMUST00000183395 105 ntBASIC4□□□□□ -1,77
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC4□□□□□ -1,77
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC4□□□□□ -1,77
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44469-201ENSMUST00000198558 79 ntBASIC4□□□□□ -1,77
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC4□□□□□ -1,77
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC3,99□□□□□ -1,77
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC3,99□□□□□ -1,77
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24202-201ENSMUST00000082948 103 ntBASIC3,99□□□□□ -1,77
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir15b-201ENSMUST00000083646 64 ntBASIC3,99□□□□□ -1,77
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3,99□□□□□ -1,77
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3,98□□□□□ -1,77
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC3,98□□□□□ -1,77
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC3,98□□□□□ -1,77
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38295-201ENSMUST00000191951 151 ntBASIC3,98□□□□□ -1,77
Ppargc1bQ8VHJ7 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC3,98□□□□□ -1,77
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC3,98□□□□□ -1,77
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC3,97□□□□□ -1,77
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC3,97□□□□□ -1,77
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC3,97□□□□□ -1,77
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC3,97□□□□□ -1,77
Ppargc1bQ8VHJ7 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC3,97□□□□□ -1,77
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3,97□□□□□ -1,77
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir487b-201ENSMUST00000102265 82 ntBASIC3,96□□□□□ -1,78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC3,96□□□□□ -1,78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC3,96□□□□□ -1,78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6985-201ENSMUST00000121255 271 ntBASIC3,96□□□□□ -1,78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC3,96□□□□□ -1,78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC3,96□□□□□ -1,78
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3,95□□□□□ -1,78
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir741-201ENSMUST00000103931 71 ntBASIC3,95□□□□□ -1,78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC3,95□□□□□ -1,78
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3,95□□□□□ -1,78
Ppargc1bQ8VHJ7 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC3,94□□□□□ -1,78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC3,94□□□□□ -1,78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC3,94□□□□□ -1,78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC3,94□□□□□ -1,78
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3,94□□□□□ -1,78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC3,94□□□□□ -1,78
Ppargc1bQ8VHJ7 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC3,93□□□□□ -1,78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm23661-201ENSMUST00000122630 87 ntBASIC3,93□□□□□ -1,78
Ppargc1bQ8VHJ7 n-R5s63-201ENSMUST00000122756 103 ntBASIC3,93□□□□□ -1,78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24009-201ENSMUST00000157734 93 ntBASIC3,93□□□□□ -1,78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC3,93□□□□□ -1,78
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3,93□□□□□ -1,78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC3,92□□□□□ -1,78
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3,92□□□□□ -1,78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3,91□□□□□ -1,78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC3,91□□□□□ -1,78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC3,91□□□□□ -1,78
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3,91□□□□□ -1,78
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3,91□□□□□ -1,78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC3,9□□□□□ -1,78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC3,9□□□□□ -1,79
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC3,9□□□□□ -1,79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC3,89□□□□□ -1,79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC3,89□□□□□ -1,79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC3,89□□□□□ -1,79
Ppargc1bQ8VHJ7 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3,89□□□□□ -1,79
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3,89□□□□□ -1,79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC3,88□□□□□ -1,79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC3,88□□□□□ -1,79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC3,88□□□□□ -1,79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm23730-201ENSMUST00000083236 107 ntBASIC3,88□□□□□ -1,79
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC3,88□□□□□ -1,79
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3,87□□□□□ -1,79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC3,87□□□□□ -1,79
Ppargc1bQ8VHJ7 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC3,87□□□□□ -1,79
Ppargc1bQ8VHJ7 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC3,87□□□□□ -1,79
Ppargc1bQ8VHJ7 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3,86□□□□□ -1,79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC3,86□□□□□ -1,79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC3,86□□□□□ -1,79
Ppargc1bQ8VHJ7 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3,86□□□□□ -1,79
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC3,85□□□□□ -1,79
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3,84□□□□□ -1,79
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC3,84□□□□□ -1,79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC3,84□□□□□ -1,79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC3,84□□□□□ -1,79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37824-201ENSMUST00000193430 3236 ntBASIC3,84□□□□□ -1,79
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC3,84□□□□□ -1,8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC3,83□□□□□ -1,8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC3,83□□□□□ -1,8
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm25974-201ENSMUST00000158701 94 ntBASIC3,83□□□□□ -1,8
Ppargc1bQ8VHJ7 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC3,83□□□□□ -1,8
Ppargc1bQ8VHJ7 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC3,83□□□□□ -1,8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164,8 ms