Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AC233699.1-201ENST00000569955 1168 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms