Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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IFT88Q13099 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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IFT88Q13099 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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IFT88Q13099 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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IFT88Q13099 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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IFT88Q13099 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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IFT88Q13099 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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IFT88Q13099 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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IFT88Q13099 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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IFT88Q13099 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 CASP1P2-201ENST00000526830 1258 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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