Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CBX1P83916 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CBX1P83916 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CBX1P83916 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CBX1P83916 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CBX1P83916 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CBX1P83916 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CBX1P83916 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CBX1P83916 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CBX1P83916 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CBX1P83916 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CBX1P83916 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CBX1P83916 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CBX1P83916 RN7SKP1-201ENST00000365525 307 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CBX1P83916 RPSAP44-201ENST00000406712 884 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CBX1P83916 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AC114402.2-201ENST00000432760 643 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AC027124.1-201ENST00000440852 466 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CBX1P83916 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AC016822.1-201ENST00000457975 439 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CBX1P83916 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CBX1P83916 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CBX1P83916 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CBX1P83916 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AC006120.1-201ENST00000579375 546 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CBX1P83916 ZEB2-AS1-206ENST00000602006 572 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AC012510.1-201ENST00000607946 759 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CBX1P83916 AL353747.4-202ENST00000625787 674 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CBX1P83916 MED31-201ENST00000225728 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CBX1P83916 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CBX1P83916 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CBX1P83916 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CBX1P83916 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CBX1P83916 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 OR4F16-201ENST00000332831 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 NCR2-201ENST00000373083 1154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 FTH1P26-201ENST00000406512 701 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 OR4F29-201ENST00000426406 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 ETF1P1-206ENST00000427296 984 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 OR4F3-201ENST00000456475 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 AC113383.1-205ENST00000502253 792 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 ENPP7P3-201ENST00000509123 241 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 AC107952.1-201ENST00000524200 376 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 OR4C1P-201ENST00000530880 937 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 AP002336.1-201ENST00000531426 422 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 RPL41P2-201ENST00000544920 409 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 AC021979.2-201ENST00000553644 209 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 AL132640.2-202ENST00000559732 614 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 DYNLRB2-204ENST00000562982 492 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 AC011193.2-201ENST00000582638 367 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 DIMT1P1-201ENST00000603970 763 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 AL353807.4-201ENST00000604995 257 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 HBG1-202ENST00000632727 369 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 OR10R2-203ENST00000641400 975 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CBX1P83916 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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