Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 RPS7P11-201ENST00000484240 586 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC139713.1-202ENST00000512366 460 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms