Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm23376-201ENSMUST00000082938 160 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm23785-201ENSMUST00000116741 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm20305-201ENSMUST00000193226 177 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm23344-201ENSMUST00000083818 68 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm25618-201ENSMUST00000179484 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm24162-201ENSMUST00000093665 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm24396-201ENSMUST00000116905 93 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm24384-201ENSMUST00000122693 75 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm22743-201ENSMUST00000083445 133 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm11966-201ENSMUST00000119907 87 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm6293-201ENSMUST00000050339 195 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm26062-201ENSMUST00000083379 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm23528-201ENSMUST00000104571 132 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm26485-201ENSMUST00000158019 64 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm26398-201ENSMUST00000179015 127 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Gm23570-201ENSMUST00000083029 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd9P28357 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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