Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top3bQ9Z321 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms