Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 253.1 ms