Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upk1bQ9Z2C6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms