Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ilf3Q9Z1X4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ilf3Q9Z1X4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ilf3Q9Z1X4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ilf3Q9Z1X4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ilf3Q9Z1X4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ilf3Q9Z1X4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ilf3Q9Z1X4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ilf3Q9Z1X4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ilf3Q9Z1X4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ilf3Q9Z1X4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ilf3Q9Z1X4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ilf3Q9Z1X4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ilf3Q9Z1X4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ilf3Q9Z1X4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ilf3Q9Z1X4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ilf3Q9Z1X4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ilf3Q9Z1X4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ilf3Q9Z1X4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ilf3Q9Z1X4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ilf3Q9Z1X4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ilf3Q9Z1X4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ilf3Q9Z1X4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ilf3Q9Z1X4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ilf3Q9Z1X4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ilf3Q9Z1X4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ilf3Q9Z1X4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms