Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx39bQ9Z1N5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms