Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms