Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syngr4Q9Z1L2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms