Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phf1Q9Z1B8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms