Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sh3bp5Q9Z131 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp5Q9Z131 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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Sh3bp5Q9Z131 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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Sh3bp5Q9Z131 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp5Q9Z131 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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Sh3bp5Q9Z131 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp5Q9Z131 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp5Q9Z131 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp5Q9Z131 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp5Q9Z131 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp5Q9Z131 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp5Q9Z131 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp5Q9Z131 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp5Q9Z131 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp5Q9Z131 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp5Q9Z131 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp5Q9Z131 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp5Q9Z131 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp5Q9Z131 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp5Q9Z131 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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