Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I6

Slfn2, Schlafen 2, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn2Q9Z0I6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slfn2Q9Z0I6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfn2Q9Z0I6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms