Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pmfbp1Q9WVQ0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pmfbp1Q9WVQ0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms