Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap4s1Q9WVL1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms