Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV18

Gabbr1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabbr1Q9WV18 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabbr1Q9WV18 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gabbr1Q9WV18 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gabbr1Q9WV18 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabbr1Q9WV18 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabbr1Q9WV18 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms