Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn5Q9WU28 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn5Q9WU28 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn5Q9WU28 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn5Q9WU28 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn5Q9WU28 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn5Q9WU28 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn5Q9WU28 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn5Q9WU28 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn5Q9WU28 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn5Q9WU28 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn5Q9WU28 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn5Q9WU28 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn5Q9WU28 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn5Q9WU28 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn5Q9WU28 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn5Q9WU28 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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