Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn4Q9WU22 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn4Q9WU22 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms