Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpv2Q9WTR1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trpv2Q9WTR1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms