Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms