Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Htra1Q9R118 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms