Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Y8

Gabrg1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg1Q9R0Y8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms