Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Zeb2Q9R0G7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Zeb2Q9R0G7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Zeb2Q9R0G7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Zeb2Q9R0G7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Zeb2Q9R0G7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Zeb2Q9R0G7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Zeb2Q9R0G7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Zeb2Q9R0G7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Zeb2Q9R0G7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Zeb2Q9R0G7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Zeb2Q9R0G7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Zeb2Q9R0G7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Zeb2Q9R0G7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Zeb2Q9R0G7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Zeb2Q9R0G7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zeb2Q9R0G7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
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