Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Plod1Q9R0E2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms