Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod2Q9R0B9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms