Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Copg1Q9QZE5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copg1Q9QZE5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms