Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms