Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps29Q9QZ88 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps29Q9QZ88 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms