Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn8Q9QZ49 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms