Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms