Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Phtf1Q9QZ09 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms