Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nphp1Q9QY53 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nphp1Q9QY53 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms