Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpsf3Q9QXK7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms