Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE0

Hacl1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacl1Q9QXE0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hacl1Q9QXE0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms