Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lsm4Q9QXA5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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