Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX98

Ptf1a, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptf1aQ9QX98 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ptf1aQ9QX98 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptf1aQ9QX98 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms