Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdkl2Q9QUK0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkl2Q9QUK0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms