Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2bQ9JME9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms