Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ap3b2Q9JME5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap3b2Q9JME5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms