Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cabp1Q9JLK7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cabp1Q9JLK7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms