Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Col5a3Q9JLI2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col5a3Q9JLI2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms