Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms